طی حکمی از سوی دکتر پورغلام رئیس پژوهشکده آقای دکتر محمدعلی افرایی به سمترئیس بخش اکولوژی منصوب گردیدند.دراین حکم با توجه به نقش دریای خزر و حوضه آبریز آن انجام مطالعات جامع اکولوژیک پیرامون اکوسیستم های دریای خزر و رودخانه های منتهی به آن،شناسائی گونه های مختلف ماهیان، پلانکتون ها، موجودات کفزی و گیاهان آبزی ، مطالعات خصوصیات زیستی آبزیان و تعیین توان تولید بمنظور اعمال مدیریت بر ذخایر، شناسایی اثرات آبزیان غیربومی در اکوسیستم دریای خزر، شناسایی عوامل و منابع آلاینده و بررسی اثرات سوء آن بر جوامع زیستی و غیر زیستی در این حوضه، مطالعه و تحقیق در زمینه ویژگیهای زیست بوم های رودخانه ای و نیز تجزیه و تحلیل و مدل سازی انبوه اطلاعات بدست آمده از پروژه های متعدد بخش در سالهای اخیر از اهم وظایف بخش بوم شناسی می باشد